L'Ermita de Sant Joan és una de les que hi ha a la part alta de la regió de Tebes a la muntanya de Montserrat. Durant anys fou residència dels abats del monestir, però a la Guerra del Francès (1811) se suposa la seva destrucció. Les restes estan ben conservades i encara es poden apreciar els murs, les terrasses i les cisternes. Aquesta ermita i la de Sant Onofre estaven unides per una passarel·la, ja que es troben molt a prop. La majoria de les ermites tenien dormitori, sala d'estudi, cuina, oratori i hort. Al segle XIX es construí la nova ermita en un replà allunyat de les roques proper a l'emplaçament de l'antiga.