En el año 1944 la Biblioteca vuelve a la Ciudadela como Biblioteca de los Museos de Arte de Barcelona. En ese momento es una biblioteca municipal especializada. De este período hay que subrayar la importante labor del entonces y hasta 1985 fue director de los Museos de Arte, Joan Ainaud de Lasarte. Joan Ainaud dio en estos  años un gran impulso a las adquisiciones, que pasan de 8.000 a 80.000 ejemplares.

1946-1947 Carnés de la Biblioteca de Josep Francesc Ràfols y Antoni Tàpies (números 100 y 62)

Estos dos carnés de lector son representativos de los usuarios de la Biblioteca en esos años. Uno corresponde a Josep Francesc Ràfols Fontanals, catedrático de la Escuela de Arquitectura e historiador del arte, y el otro a un jovencísimo Antoni Tàpies, en su etapa de formación.